我们知道，朱元璋一开始最满意的继承人，是自己的大儿子朱标，他的一切都是按照皇位继承人来培养的，朱元璋甚至没想过除了朱标之外的人。但是谁也没想到，太子朱标最终死的早，还没等朱元璋传位，他就死了，明朝的继承人再度成了一个大问题。而皇孙朱允炆继位之后，朱棣又夺了侄子的皇位，那在朱棣登基之后，他又是怎么对待朱标之前留下的后人们的呢?
洪武二十五年，大明帝国皇太子朱标病逝，时年三十七岁，这个从封吴王世子起，被精心培育近三十年的长子去世，令朱元璋悲痛欲绝。白发人送黑发人后，朱元璋面临一个迫切问题，当选何人为新的帝国储君?根据封建礼法的嫡长子继承制，嫡长子先死时，若长子有孙则必当立孙，无论其孙是嫡是庶。
而从此时朱元璋的角度，可以看到之前帝王，在太子死后改立其他皇子的两例，即使是孙权和萧衍这两个堪称一时人杰的开国之君，亦皆以失败告终，一个导致“二宫之乱”，幼主即位大权落于权臣;另一个更直接让侯景之乱时，诸王拥兵不前，坐等老父和兄长败死，国家因此灭亡。前车之鉴如此，怎能不加慎重?
其实道理也很简单，不论改立哪个皇子，其他皇子都必然心怀不满：原本大家都无份大位，平起平坐，凭什么让你仅仅因为太子去世就登龙门?
此时大明有秦王、晋王、燕王、周王等多个年富力强、而且分藩一方，麾下甚至有重兵在手的成年皇子。无论选立他们其中何人，已经暮年的朱元璋都不得不考虑自己身后，是否会发生骨肉人伦惨变的可能。而这正是重视儿孙亲情的朱元璋所最不愿意的。
既然立其他皇子，对此时的大明帝国并不可行，那么就只能立先太子朱标一系的皇孙了。朱元璋择储时，朱标嫡长子朱雄英早夭，最后选定朱允炆为皇太孙，其实并不完全符合儒家礼制， 因为尚有更明正言顺的嫡孙朱允熥在。
毕竟朱允炆生母吕妃是侧室扶正的继室，无论身前死后，对朱允熥的生母常妃都要敬以正嫡之礼，而自居侧位。当时的儒家嫡庶礼制，继室虽然也是正室夫人，但是地位低于原配。如明清时地方大族的规定：
【妻所以承宗庙,初娶曰娶,再娶曰继,纳妾曰纳,以明嫡庶之分也。妾有子女则书,无则不书。】【纳妾后,嫡没再娶,以再娶之妇为继室,书于嫡室之后,妾次之,所以正名分别尊卑也。】
就连继立皇后在祭奠原配皇后时，也是要行侧室对正室的礼节的。如清代宫廷文件显示：乾隆元后富察氏死后，每到其生辰和忌日，继后那拉氏都要带子女嫔妃去她的牌位前祭拜，并且执妾室礼。慈安太后钮钴禄氏祭祀咸丰帝时，也要空出左边为尊的位置，留给咸丰元配皇后萨达克氏，而慈禧太后更只能和其他妃嫔一样跪在后面。
因此严格地说，朱允熥的继承次序高于作为兄长的朱允炆。两个孩子年纪相仿，也无论贤愚。
朱元璋的最后选择，应当更多是基于常氏外戚势大，各家军事勋贵连根错节的隐忧， 毕竟朱允熥的外祖父便是一代名将开平王常遇春，两个舅父是郑国公常茂和开国公常升。而凉国公蓝玉则是他母亲的舅舅，俗称“舅姥爷”。这样强大的外戚势力，绝不是一个年纪幼小的朱允熥能驾驭的。
相比之下， 吕妃为原吏部尚书吕本之女，并无血亲兄弟， 朱允炆可谓外家全无势力，才更来得放心。所以，为了给朱允炆消除隐患，朱元璋不久便兴起了“蓝玉大狱”，先后诛杀了蓝玉、冯胜、傅友德等三位战功赫赫的名将兼国公， 开国公常升同样死于连坐，同批被杀的侯爵和军队中高层将领，更不计其数。
常家和蓝玉一党，原本是朱元璋为朱标精心安排的帝国第二代军队中坚，如今为了孙子能够坐稳江山，竟不惜将他们兴大狱诛灭殆尽，牵连甚广，亦可说是造化弄人。
同时，为了补偿不但失去皇位，而且母家尽数被诛杀的朱允熥，朱元璋去世后，他被封为吴王， 藩地是浙江首府杭州。需知朱元璋建立大明前，当了8年吴国公，4年吴王，这个封号实非人臣所当有。而江南财赋重地，本来亦无封建藩王之理。
老祖父临终前一片良苦用心，是希望二孙子能够坐稳江山，三孙子也能在风景如画的人间天堂当个富贵闲王：留得西湖明月在，何愁无处下金钩?
然而，这一切安排，都被燕王朱棣发动的靖难之变所毁。朱棣攻克南京，自立为帝后， 朱允炆失踪或者自焚。 朱棣更下令收缴焚毁建文帝时期的相关奏书、政府公告、私人笔记，并为了否定朱标一脉的继位合法性，信口雌黄捏造所谓《奉天靖难记》，为永乐一朝官方史书，而该书着重污蔑的三人，即已去世的朱标，再加朱允炆和朱允熥兄弟。甚至胡扯出「朱允炆和朱允熥兄弟对着朱元璋棺木仗剑大骂」的奇闻。
【允炆矫遗诏嗣位，忘哀作乐，用巫觋以桃茢祓除宫禁，以硫磺水徧洒殿壁，烧诸秽物以辟鬼神。梓宫发引，与弟允熥各仗剑立宫门，指斥梓宫曰：“今复能言否?复能督责我否?”言讫皆笑，略无戚容。】
【允炆日益骄纵，焚太祖高皇帝、孝慈高皇后御容，拆毁后宫，掘地五尺，大兴土木，怨嗟盈路，淫佚放恣，靡所不为。遣宦者四出，选择女子，充满后宫，通夕饮食，剧戏歌舞，嬖幸者任其所需，谓羊不肥美，辄杀数羊以厌一妇之欲。又作奇技淫巧，媚悦妇人，穷奢极侈，暴殄天物，甚至亵衣皆饰以珠玉锦绣。各王府宫人有色者，皆选留与通，常服淫药，药燥性发，血气狂乱，御数老妇不足，更缚牝羊母猪与交。荒眈酒色，昼夜无度。及临朝，精神昏暗，俯首凭桉，唯唯数事而已。宫中起大觉殿，于内置轮藏。 出公主与尼为徒，敬礼桑门，狎侮宗庙。尝置一女子于盒以为戏，谓为时物，舁入奉先殿荐新，盒开聚观，大笑而散。倚信阉竖，与决大事，凡进退大臣，参掌兵马，皆得专之。陵辱衣冠，毒虐良善，御史皆被棰挞。纪纲坏乱，构成大祸。】——朱棣编撰奇书《奉天靖难记》
因该书种种光怪陆离之处，连满清修《明史》的史官都看不下去，没有跟着照录。平心而论，幸亏如此，否则不止是朱允炆朱允熥兄弟，不止是立朱允炆为储君的朱元璋，恐怕就连朱棣自己的声誉，也要因之被累及了。
朱标本有五个儿子，虞怀王朱雄英早夭，惠帝朱允炆并其长子朱文奎，于南京城破时不知所踪。 朱允熥先是被降封郡王，再加诸“弗知省躬，自生疑怼”之罪，被废为庶人，囚禁于凤阳高墙之内。衡王朱允熞、徐王朱允熙亦被降封郡王，后相继被朱棣禁锢。
永乐四年二月，东陵一场诡异大火，夺去被禁锢守陵的朱标继妻吕后和幼子朱允熙性命。「永乐四年二月邸中忽火起，(允熙)惊仆地，卒年十六。」
永乐十五年，谷王朱橞和蜀藩崇阳王朱悦燇合谋，欲以建文帝为名起兵，被朱棣查办。此事后不久，未满四十的朱允熥即暴卒，不排除是朱棣为杜绝可能隐患，而暗下毒手的可能。
朱允熞同样被废为庶人，禁锢若干年后死，无子嗣。
朱允炆次子朱文圭被禁锢凤阳五十余年，即所谓“建庶人”，于明英宗天顺年间被放出，不久即死。其实同时放出的还有所谓“吴庶人”，即朱允熥之后。明英宗派了几个内使照料他们起居，每月支给米柴。但只许与其亲戚往来，出入购置衣食，而禁止和其他百姓、各王府来往，仍等同变相软禁。
按《万历野获编》的说法，到了明宪宗成化三年，朱文圭和朱允熥后裔相关人口，所谓的建庶人和吴庶人亲族，已只剩十三人，而且衣物敝尽，生活困苦。
明孝宗弘治年间，有官员上书，请封文圭后裔为王，奉朱标祀，被通政司大怒囚禁，明孝宗不以为罪而释放。其后若干年，朱允熥一脉先绝，朱文圭一脉亦绝。虽英宗、宪宗两朝“优恤”，朱标终究就此绝嗣。
弘治中台州人缪恭走京师, 上书言六事, 其一请封建庶人之后为王, 以奉懿文祀。 通政司大怒, 谓 为讨死, 囚之兵马司, 以其疏上。 上不罪也。——《万历野获编》
成化三年九月，南司礼太监覃包等奏：“建庶、吴庶，自天顺初安置凤阳，其带帐幔靴，俱已敝尽。又人口一十八名，岁给布缣绵絮，今死亡者五人，因而减给。所买女奴六人，俱无衣布，宜为修补。”诏下工部勘给之。时吴庶先卒，懿文太子之后，仅存建庶一人，其后释放又卒，嗣遂绝。两朝仁厚，虽加优恤，而无救于若敖之馁。——《万历野获编》
读史至此，不得不掩卷长叹，朱棣开创“永乐盛世”，文治武功甚为可观，堪为千古一帝，然而他生平最可非议之处，就是绝了其父朱元璋最心爱的长兄朱标一脉的后嗣。朱元璋岢于功臣，而厚于亲族;朱棣岢于亲族，而厚于功臣。 两父子在这点上恰好是个鲜明对比。
一直到京师城陷，明毅宗崇祯帝殉国，南明安宗弘光帝继位后，国难思忠良，才开始对有明二百余年累积的冤案统一做了平反。
包括追复懿文太子朱标为兴宗康皇帝，建文帝朱允炆为惠宗让皇帝，朱祁钰为代宗景皇帝，连其皇后常氏、马氏、汪氏并上尊号和十三字谥号齐全。同时给洪武朝被冤杀的开国功臣冯胜、傅友德、廖永忠等诸公侯;靖难时被屈杀的建文忠臣长兴侯耿炳文、方孝孺、齐泰、黄子澄、景清、卓敬;正德朝被杖杀的蒋钦、陆震;天启朝被阉党害死的左光斗、顾大章等，一起平反昭雪、追加谥号。
除了朱标和朱允炆父子恢复了应有的帝位尊荣，朱允熥被追封吴悼王，朱允被追封徐简王，朱允熞被追封衡愍王。
而清修《明史》虽不承认南明弘光政权的合法地位，由乾隆帝另外给朱允炆追封了“ 恭闵惠皇帝”的谥号。但朱标的“兴宗康皇帝”因为是建文一朝就已追封，因此还是写在史书中，作为正式称号被后世史家一致认可。对这位天性仁慈、厚德载物的开国皇太子，也算是不幸中的小小欣慰了。