朱元璋虽然收复了燕云十六州，将蒙古大军击退至漠北，但并没有彻底消除蒙古的威胁。此后清军却把蒙古彻底击溃，还把蒙古的统治权给收入囊中，清军究竟是怎样做到的呢?其实早期清军八旗和蒙古是盟友关系，但清军也明白一旦入关以后，蒙古肯定也想分一杯羹，所以就要提前削弱蒙古的力量。也是经过一系列的政策才把蒙古给悄然改变，下面就一起来看看究竟是如何做到的吧。
明朝建立后，朱元璋命令大军北伐先是收复了沦陷400多年的燕云之地，终于将蒙古赶回了漠北。随后大军再次出征，消灭了蒙元残部，使得蒙古彻底分裂。后来，朱棣登基后再次远征，蒙古各部在明军攻击下溃不成军，可蒙古对明廷的威胁依旧存在，“土木堡之变”就是最好的说明。
纵观大明一朝两百多年，未能彻底降服，可却被清朝几十年就彻底解决了，这是为何?在经典历史剧《康熙王朝》里出现过这样一段台词，康熙皇帝认为明朝花了如此多的人力、财力、物力修建了修建加固了万里长城，却挡不住满清八旗骑兵，更挡不住北方蒙古人不断南下袭扰。
于是，一些人就想当然认为清朝八旗军的战斗力远胜明军，蒙古这是甘愿臣服。原因远没有如此简单，清朝之所以彻底解决蒙古问题，关键在于三条妙计。
第一个妙计，无下限地拉拢蒙古人，或者说让一部分蒙古人直接变成自己人。在后金崛起过程中，八旗与蒙古和亲，孝庄文皇后就是标志性人物。跟着大明喝粥，跟着满清喝汤吃肉，你说跟谁混?
第二个妙计，满清皇帝兼任蒙古大汗。清朝皇帝有多重身份，既是八旗之主、蒙古大汗，又是汉人皇帝，甚至还兼任蒙藏地区的宗教领袖。蒙古人反满清，就意味着跟自己造反。
第三个妙计，实行盟旗制度，从根本上解决问题。这是分化蒙古的绝招，它从根本上将蒙古上层牢牢掌控手中。作为游牧民族，蒙古人逐水草而居，骑兵更是来去如风，这种无固定驻地的行军方式，让中原王朝吃尽了苦头。
反观盟旗制度，最大特点就是将蒙古旧地一块块地划分，每一块区域内的蒙古部落不允许越界放牧，限制了蒙古人的活动范围。盟旗制度的建立，极大地限制了各族封建主之间为争夺牧民和牧场而引起的战争，同时由盟长监督和控制各旗，也达到削弱蒙古内部各封建主势力的目的，有利于满清对蒙古各部的统治。
除了上面三个妙计外，此时的蒙古早已不是当年的蒙古部落，随着北方沙俄的崛起，蒙古人的生存空间被进一步压缩。在盟旗制度下，蒙古人的经济基础早已从游牧制度逐渐转为畜牧制度，把人口跟草原、耕地紧密捆绑在一起。