随二战末期日本签署了《无条件投降书》之后，席卷了全球61个国家，维持了6年的第二次世界大战终于是结束了。但是正当全世界反法西斯人民都在庆祝胜利的时候，驻守在太平洋地区的美国海军在靠近日本本土的海域上拦截了一艘“奇怪的潜艇”，这艘潜艇不仅大小惊人，而且可以起降鱼雷轰炸机。
后经调查，美国人发现了曾被日本军方视为绝密的“航空潜舰计划”，一个可能改变战争走向的“阴险计划”。
1941年12月7日，日军偷袭珍珠港，将此前一直采取绥靖政策的美国拉进了战争的泥沼中，太平洋战争由此爆发。在珍珠港事件的第二天，美国对日宣战，并迅速开始动员，启动了它庞大的工业力量……
对于美国人来说，珍珠港事件是一场毫无意义的挑衅，但对于日本人来说，这场袭击是一场关乎国家存亡的“豪赌”。 因为随着日本持续扩大在亚洲的版图，日本人相信此前一直尽量避免战争的美国参与战争只是时间问题。
珍珠港事件背后的谋划者山本五十六，打算一口气消灭美国太平洋舰队的主力部队，令美国海军放弃太平洋海域，但山本五十六严重低估了美国海军的军事力量，珍珠港事件后，被激怒的美国开始反击。
面对美国的反击，山本五十六知道自己奇袭美国的计划失败了，而失败的代价就是将强大的美国提前逼到了日本的对立面，面对美国愤怒的反击，山本五十六想了另一种策略，迫使美国重新考虑在太平洋上的战争。
他计划建造一支携带多架轰炸机的“潜艇舰队”，绕过美军的防守后对美国各城市发动突袭，之后再度下潜消失，以此牵制美国海军。但自珍珠港事件后，美国就时刻警惕着日军，因此，山本需要一个能隐形到达美国的武器，一个美国人永远也猜不到的武器——“航空潜舰”。
1942年3月，日本吴海军工厂承接了设计山本“航空潜舰”的巨大任务。但这个任务的难点在于，“航空潜舰”需要能够发射全尺寸的鱼雷轰炸机，为此工程师必须设计一套弹射器发射系统，还需要设计一种回收飞机的装置来将它们回收到船上。
但如何将轰炸机缩小放进一艘潜艇里，这对工程师来说是个巨大的挑战。
在当时，俯冲轰炸机翼展约为12米，为此，工程师需要设计一架全新的轰炸机，一架可以折叠并放进潜艇机库的轰炸机。而这艘秘密建造的“航空潜舰”也被军方日本命名为伊400级潜艇。
很快，日本吴海军工厂就设计出了“伊400初稿”，它的长度是德国U型潜艇的两倍，而为了能够支撑机库的重量及提升潜艇航行时的稳定性，工程师创新性地设计了双船体结构，这让伊400和美国最大潜艇排水量相比下有将近三倍之大。
伊400在设计来说是一艘厉害的潜艇，它配备了八个前置鱼雷发射管，和一门巨大的14cm甲板炮，而为了抵御敌机，它还有高射炮三座及单装炮一挺，当然，伊400的主要武器是三架鱼雷轰炸机，奇袭的特性是水下航空母舰的最大优势。
当伊400默默地接近其目标时，这艘巨大的潜水艇会在距离目标几百公里远时浮出水面，三架轰炸机将如竞赛般的升空，每架飞机将从机库移至甲板上，接着，机组人员会启动引擎、展开机翼和尾翼， 将浮桶锁定到位和装载武器，三架飞机将使用压缩空气弹射器依序发射，整个过程将花费三十分钟。
在那之后，伊400将会下潜回安全区，而当轰炸机完成任务时，伊400会再次浮出水面，将这些“浮桶飞机”通过可折叠的液压起重机回收至船上。
尽管伊400的设计非常好，不仅结合了潜艇的隐身特性及航空母舰的进攻打击能力，但日本战败的结局注定不会因“它”而改变，
1945年8月15日，在偷袭珍珠港的近四年后，在美国两枚原子弹的轰炸下，日本无条件投降了，而美国人在日本投降的两周后，在日本海域上拦截了一艘伊400级潜艇，起初，美国人相信伊400是被设计用来运载货物的，因为日本船员已将所有的攻击机丢下潜艇，但很快，随着美国人的深入调查，他们揭开了伊400的真正用途，以及日本为何从未在战争中使用过它。
首先，因为设计这样的非常规武器，吴海军工厂花了将近一年的时间，导致第一批伊400在1943年初才开始建造，但此时日本在战争已处于劣势，而且，日本在那时因美国封锁了对日贸易，导致日本严重缺乏原油和原材料，这更延后了伊400的建造，
山本五十六原本计划建立一支18艘“航空潜舰”的计划，最终缩减到只有5艘，并且最后也只有3艘完工，第一艘在1945年服役，但那时正处于战争末期，日本军队早已崩溃，用几架轰炸机向美国城市发起偷袭，不仅改变不了战争结局，甚至还会激怒美国人，这对日本人来说毫无意义。
伊400的第一次且是最后一次执行任务，是轰炸一个聚集在太平洋环礁上的美军部队，但是当伊400前往他们的的目标时，日本就已经投降了。
“航空潜舰计划”对山本五十六来说，是一场关乎日本存亡的赌博，一种增加日本胜利筹码的方法，如果让这些潜艇在战争开始时出现，可能会改变战争走向，但种种原因，导致日本“航空潜舰计划”并未发挥真正作用。
尽管如此，美国人依然认为伊400是个危险的武器，特别是落在敌人的人手里。1946年，苏联要求自行检查日本伊400级潜艇，但美国拒绝了苏联的要求，并将伊400带回美国本土进行技术调查，最后在夏威夷近海做为靶舰击沉，并对残骸的沉默位置保密，以防止对手进行打捞。